Отдел молекулярной генетики МРНЦ имени А.Ф. Цыба

Шинкаркина Анна Петровна

ДОЛЖНОСТЬ: заведующая отделом молекулярной генетики МРНЦ имени А.Ф. Цыба – филиала ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России
УЧЕНАЯ СТЕПЕНЬ: кандидат биологических наук
ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ НАУЧНОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ: выявление соматических и герминальных мутаций в таргетных генах и поиск новых генетических вариантов, ассоциированных с онкологическими заболеваниями для улучшения диагностики, прогноза и персонализированного лечения онкологических заболеваний.

Шинкаркина Анна Петровна – заведующая отделом, кбн
Конова Марина Викторовна – биолог
Макарчук Виктория Михайловна – старший научный сотрудник, кбн
Михайлова Галина Федоровна – ведущий научный сотрудник, дбн
Мурзаева Алена Валерьевна — младший научный сотрудник
Петухова Наталья Сергеевна — инженер 1 категории
Северская Наталья Викторовна — врач-лабораторный генетик, к.м.н.
Цепенко Виктория Викторовна, биолог, кбн
Боровик Надежда Захаровна, лаборант
Еремина Татьяна Анатольевна – лаборант

Исследование молекулярно-генетических маркеров, влияющих на эффективность таргетных противоопухолевых препаратов (гены KRAS, NRAS, BRAF у пациентов с колоректальным раком; гены EGFR, BRAF и KRAS при немелкоклеточном раке легких; гены BRAF, NRAS, cKIT у пациентов c меланомой; гены cKIT, PDGFRα у пациентов с гастроинтестинальными стромальными опухолями)
Исследование маркеров наследственной предрасположенности к онкологическим заболеваниям (ген RET при наследственных формах медуллярного рака щитовидной железы и синдрома множественной эндокринной неоплазии; гены BRCA1, BRCA2, CHEK2 при наследственных формах рака молочной железы и рака яичников)
Изучение маркеров диагностики и прогноза рака щитовидной железы (мутаций гена BRAF, NRAS, HRAS,TERT)
Выявление микросателлитной нестабильности при различных опухолях
Развитие и внедрение технологий секвенирования нового поколения (NGS) для молекулярного профилирования опухолей и изучения маркеров диагностики, прогноза и лечения
Участие в международных протоколах по изучению новых подходов к системному лекарственному и комбинированному противоопухолевому лечению

Результаты лечения наследственного медуллярного рака щитовидной железы в зависимости от типа мутации в гене RET и возраста проведения хирургического лечения. Северская H.В., Шинкаркина А.П., Ильин А.А., Чеботарева И.В. Свидетельство о регистрации базы данных RU 2020620665, 10.04.2020. Заявка № 2020620462 от 20.03.2020.
База данных оборудования и расходных материалов, использующихся для комплексной молекулярно-генетической диагностики в онкогинекологии, включая методы высокопроизводительного секвенирования. Шаталов П.А., Шегай П.В., Шинкаркина А.П., Земский П.Ю. Свидетельство о регистрации базы данных RU 2020620626, 30.03.2020. Заявка № 2020620436 от 18.03.2020.
База данных оборудования и расходных материалов, использующихся для комплексной молекулярно-генетической диагностики в онкогастроэнтерологии и колопроктологии, включая методы высокопроизводительного секвенирования. Шаталов П.А., Шегай П.В., Шинкаркина А.П., Земский П.Ю. Свидетельство о регистрации базы данных RU 2020620627, 30.03.2020. Заявка № 2020620437 от 18.03.2020.
Медуллярный рак щитовидной железы: молекулярно-генетический скрининг больных и членов семей с 1999 по 2019 годы. Северская Н.В., Шинкаркина А.П., Ильин А.А., Исаев П.А., Желонкина Н.В., Чеботарева И.В., Румянцев П.О. В книге: Сборник тезисов VIII (XXVI) национального конгресса эндокринологов с международным участием «Персонализированная медицина и практическое здравоохранение». 2019. С. 124-125.
Мутация гена BRAF V600 в опухолевых клетках — фактор неблагоприятного течения меланомы кожи? Абрамова О.Э., Кудрявцев Д.В., Шинкаркина А.П., Гуменецкая Ю.В., Кудрявцева Г.Т., Конова М.В. Саркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи. 2019. Т. 11. № 2. С. 12-17.
Неинвазивная фоликуллярная опухоль щитовидной железы с ядрами папиллярного типа. Зибиров Р.Ф., Корецкая А.Е., Сидорин А.В., Шинкаркина А.П., Мозеров С.А. Онкология. Журнал им. П.А. Герцена. 2019. Т. 8. № 5. С. 358-361.
Применение экзомного секвенирования на платформе mgi для скрининга маркеров наследственных форм злокачественных новообразований.- Успехи молекулярной онкологии. Материалы VII Всероссийской конференции по молекулярной онкологии 21–23 декабря 2022 г., Москва.- 2022.-Серия: 4.-Том: 9.- С.72-73. Мурзаева А.В., Шинкаркина А.П., Шаталов П.А., Романова М.Э
База данных молекулярно-генетических нарушений гена BRAF у больных меланомой кожи.- Шинкаркина А.П., Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Мурзаева А.В., Конова М.В., Цепенко В.В., Голуб Е.В. //Официальный бюллетень федеральной службы по интеллектуальной собственнорсти, патентам и товарным знакам. Изобретения. Полезные модели. 2022.- №3 RU2022620511.
База данных молекулярно-генетических нарушений у больных немелкоклеточным раком легкого.- Шкаврова Т.Г., Шинкаркина А.П., Михайлова Г.Ф., Мурзаева А.В., Конова М.В., Цепенко В.В., Голуб Е.В.//Официальный бюллетень федеральной службы по интеллектуальной собственнорсти, патентам и товарным знакам. Изобретения. Полезные модели. 2022. №3 RU2022620535
Способ оценки первичного ответа на проводимую комбинированную химиотерапию спорадического рака яичников III и IVстадий.- Иванова Т.И., Крикунова Л.И., Сыченкова Н.И., Хорохорина В.А., Шинкаркина А.П., Мурзаева А.В., Иванов С.А., Шегай П.В., Каприн А.Д.-Патент на изобретение 2769543 C2, 01.04.2022.
Ассоциация генотипа ɛ3ɛ3 аполипопротеина Е с общим ответом на первую линию комбинированной химиотерапии распространенного рака яичников .- Иванова Т.И., Сыченкова Н.И., Шинкаркина А.П., Хорохорина В.А., Мурзаева А.В., Крикунова Л.И. Вопросы онкологии. 2022. Т. 68. № S3. С. 220-221.
Оценка частоты встречаемости молекулярных нарушений в опухолевых клетках при злокачественных новообразованиях молочной железы методом высокопроизводительного секвенирования.- Романова М.Э., Гриневич В.Н., Волченко Н.Н., Прокопенко С.П., Кудрявцева А.В., Шаталов П.А., Шинкаркина А.П., Райгородская М.П., Никифорович П.А., Суркова В.С., Кокосадзе Н.В., Сенцова Е.Ю., Федорова М.С., Мамедов И.З., Алексеев Б.Я., Шегай П.В., Полозников А.А., Каприн А.Д.- Онкология. Журнал им. П.А. Герцена. 2021;10(4):23-29.
Анализ показателей липидного обмена у пациенток с наследственным и спорадическим раком яичника.- Иванова Т.И., Мурзаева А.В., Шинкаркина А.П.,Полуэктова М.В.,Сыченкова Н.И.,Хорохорина В.А.,Конова М.В., Чиркова Т.В., Крикунова Л.И.- //Сборник трудов Х Международная научно-практическая конференция “Молекулярная диагностика”. Москва. 2021. T. 1, С. 127-128
Статус микросателлитной нестабильности и частота соматических мутаций в генах KRAS, NRAS и BRAF при колоректальном раке.- Мурзаева А.В., Конова М.В., Жаворонкова Е.С., Двинских Н.Ю., Шинкаркина А.П.- //Сборник трудов Х Международная научно-практическая конференция “Молекулярная диагностика”. Москва. 2021. T. 1, С. 72-73
Результаты лечения наследственного медуллярного рака щитовидной железы в зависимости от типа мутации в гене RET и возраста проведения хирургического лечения. Северская H.В., Шинкаркина А.П., Ильин А.А., Чеботарева И.В.-Свидетельство о регистрации базы данных RU 2020620665, 10.04.2020. Заявка № 2020620462 от 20.03.2020.
Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Шкаврова Т.Г., Голуб Е.В. Асинхронная репликация у онкологических больных. Успехи молекулярной онкологии. 2018;5(1):26-34.
Хмелевская В.Н., Куприянова Е.И., Цепенко В.В. Клинический случай длительного наблюдения больной после излечения саркомы Юинга костей таза с метастазами в регионарные лимфатические узлы и в правое легкое//Саркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи. 2019. №1. С. 34-42.
Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Голуб Е.В. Нарушения в локусе тяжелых цепей иммуноглобулинов у больных хроническим лимфоцитарным лейкозом, выявляемые методом флуоресцентной in situ гибридизации. Патогенез. 2019; 17(3): 57-64. DOI: 10.25557/2310-0435.2019.03.57-64
Голуб Е.В., Шкаврова Т.Г., Полькин В.В., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Севрюков Ф.Е., Медведев В.С., Исаев П.А. Молекулярно-цитогенетические нарушения в клетках слущенного эпителия у больных раком слизистой оболочки полости рта// Патогенез. 2019; 17(4): 69-77. DOI: 10.25557/2310-0435.2019.04.69-77
Цепенко В. В., Михайлова Г. Ф., Шкаврова Т. Г., Голуб Е. В., Рухадзе Г. О., Скоропад В. Ю. Асинхронная репликация генов AURKA и TP53 у больных солитарном раком желудка и у больных с полинеоплазиями //Успехи молекулярной онкологии. 2019; 6(2):42-47.
Полькин В.В., Михайлова Г.Ф., Шкаврова Т.Г., Цепенко В.В., Севрюков Ф.Е., Исаев П.А. Молекулярно-цитогенетические нарушения хромосомы 11 в опухолевых клетках слизистой оболочки полости рта до и после лучевой терапии как показатель индивидуальной радиочувствительности // Тезизы Невский радиологический форум 2019. С.Пб. 12-13 апреля 2019 г.//Лучевая диагностика и терапия.2019. №1 (S). С. 115.
Голуб Е.В., Полькин В.В., Михайлова Г.Ф., Шкаврова Т.Г., Цепенко В.В., Севрюков Ф.Е., Медведев В.С., Исаев П.А. Нарушение копийности генов EGFR и CCND1 в опухолевых клетках слизистой оболочки полости рта до и после лучевой терапии как показатель индивидуальной радиочувствительности// Беларусь, г. Гомель, 23-24 мая 2019 г. «Современные проблемы радиационной медицины: от науки к практике» Материалы Международной научно-практической конференции /Под общ. ред. д.м.н., доц. А.В. Рожко. – Гомель, ГУ «Республиканский научно-практический центр радиационной медицины и экологии человека». – Гомель: ГУ «РНПЦ РМиЭЧ», 2019. – С. 7.
Голуб Е.В., Михайлова Г.Ф., Шкаврова Т.Г., Цепенко В.В., Полькин В.В., Панасейкин Ю.А., Исаев П.А. Оценка нестабильности генома у больных раком слизистой оболочки полости рта по частоте клеток с полисомией хромосом 7 и 11 после гамма-лучевой терапии. 3-я Российская конференция с международным участием «Радиобиологические основы лучевой терапии» Дубна, 17-18 октября 2019 г. – Дубна: ОИЯИ, 2019. — C. 45-47.
Цепенко В.В., Михайлова Г.Ф., Шкаврова Т.Г. Голуб Е.В., Рухадзе Г.О., Скоропад В.Ю. База данных о нарушении числа копий гена AURKA у больных раком желудка и больных с полинеоплазиями // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №6, 2019. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU 2019621062.
Цепенко В.В., Михайлова Г.Ф., Шкаврова Т.Г. Голуб Е.В., Рухадзе Г.О. База данных о частоте лимфоцитов с асинхронной репликацией гена TP53 в периферической крови больных с опухолевой патологией желудочно-кишечного тракта // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №10, 2019. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2019621690.
Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Голуб Е.В., Даниленко А.А., Богатырева Т.И. База данных о частоте лимфоцитов с асинхронной репликацией гена AURKA в периферической крови у онкогематологических больных // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №10, 2019. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2019621732.
Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Голуб Е.В. База данных по динамике частоты аберраций хромосом у жителей Калужской области, внутриутробно облучившихся в результате аварии на Чернобыльской АЭС в отдаленные сроки// Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №11, 2019. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2019622068
Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Голуб Е.В., Даниленко А.А. Молекулярно-цитогенетические нарушения у больных хроническим лимфоцитарным лейкозом с прогрессией заболевания. Генетика человека и патология: актуальные проблемы клинической и молекулярной цитогенетики: сборник научных трудов /под ред. В.А. Степанова. Вып. 12. – Томск: Литературное бюро. 2019. – С. 70-71.
Голуб Е.В., Михайлова Г.Ф., Шкаврова Т.Г., Полькин В.В., Панасейкин Ю.А., Исаев П.А. Динамика частоты клеток с амплификацией гена EGFR у больных раком слизистой оболочки полости рта после γ-лучевой терапии //Материалы научно-практической конференции «Радиация и организм» Обнинск, 28 ноября 2019 г., Обнинск: МРНЦ им. А.Ф. Цыба — филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России. 2019. С. – 37-38.
Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Шкаврова Т.Г., Рухадзе Г.О., Черкесов В.Н. Частота лимфоцитов с асинхронной репликацией генов AURKA и TP53 у больных солидными опухолями ЖКТ в отдаленные сроки после лечения // Материалы научно-практической конференции «Радиация и организм» Обнинск, 28 ноября 2019 г., Обнинск: МРНЦ им. А.Ф. Цыба — филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России. 2019. С. – 117-118.
Шкаврова Т.Г., Голуб Е.В., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Иванов С.А., Каприн А.Д. Способ получения цитогенетических препаратов клеток эпителия для проведения реакции флуоресцентной in situ гибридизации // Официальный бюллетень федеральной службы по интеллектуальной собственнорсти, патентам и товарным знакам. Изобретения. Полезные модели. 2019. № 32. Изобретение №2706220.
Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Голуб Е.В., Даниленко А.А., Шахтарина С.В. База данных о частоте делеций в локусе 14q32 в лимфоцитах периферической крови клинически здоровых лиц и больных хроническим лимфоцитарным лейкозом // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №3, 2020. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2020620371.
Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Голуб Е.В., Полькин В.В. База данных о частоте клеток с анеусомией хромосом 7 и 11 в слущенном эпителии у больных раком слизистой оболочки полости рта // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №3, 2020. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2020620417.
Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Голуб Е.В., Даниленко А.А., Шахтарина С.В. База данных о частоте лимфоцитов с молекулярно-цитогенетическими нарушениями у больных хроническим лимфоцитарным лейкозом // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №3, 2020. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2020620432.
Шкаврова Т.Г., Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Голуб Е.В., Полькин В.В. База данных о частоте нарушений копийности генов CCND1 и EGFR в клетках слущенного эпителия у больных раком слизистой оболочки полости рта // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №3, 2020. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2020620433.
Цепенко В.В., Михайлова Г.Ф., Шкаврова Т.Г., Голуб Е.В. База данных о частоте нестабильных аберраций хромосом у детей и подростков, проживающих в Калужской области // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №3, 2020. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2020620443.
Шахтарина С.В., Даниленко А.А., Фалалеева Н.А., Шкаврова Т.Г. База данных семейной агрегации больных лимфомой Ходжкина // Официальный бюллетень «Программы для ЭВМ. Базы данных. Топологии интегральных микросхем» №5, 2020. Государственная регистрация базы данных, охраняемой авторскими правами RU2020620705.
Михайлова Г.Ф., Цепенко В.В., Шкаврова Т.Г., Жаворонкова Е.С., Скоропад В.Ю. Нарушение копийности генов AURKA и CDKN2A у больных раком прямой кишки до и после неоадъювантной химиолучевой терапии// Материалы научно-практической конференции «Радиация и организм» Обнинск, 26 ноября 2020 г., Обнинск: МРНЦ им. А.Ф. Цыба — филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России. 2020. С. – 58-59.